Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChfrQ810L3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ChfrQ810L3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms