Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg2bQ80XK6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atg2bQ80XK6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms