Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ttc28Q80XJ3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ttc28Q80XJ3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Ttc28Q80XJ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc28Q80XJ3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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