Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acsm4Q80W40 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Acsm4Q80W40 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Acsm4Q80W40 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Acsm4Q80W40 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acsm4Q80W40 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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