Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmcc2Q80W04 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms