Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cfap100Q80VN0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cfap100Q80VN0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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