Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Usp8Q80U87 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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