Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
NischQ80TM9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NischQ80TM9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
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