Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc42bpbQ7TT50 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms