Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSE6

Stk38l, Serine/threonine-protein kinase 38-like, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk38lQ7TSE6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk38lQ7TSE6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms