Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2lQ7TS74 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms