Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Actn1Q7TPR4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Actn1Q7TPR4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms