Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HhipQ7TN16 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HhipQ7TN16 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms