Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shq1Q7TMX5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shq1Q7TMX5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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