Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ScocQ78YZ6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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