Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd1cQ76I25 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Higd1cQ76I25 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms