Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rph3alQ768S4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms