Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms