Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Syne1Q6ZWR6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms