Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd3Q6ZQK0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms