Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot1Q6ZQ08 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cnot1Q6ZQ08 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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