Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smpd4Q6ZPR5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms