Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kcnt1Q6ZPR4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Kcnt1Q6ZPR4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kcnt1Q6ZPR4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms