Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc88cQ6VGS5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms