Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Timd4Q6U7R4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Timd4Q6U7R4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms