Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nudcd1Q6PIP5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms