Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med16Q6PGF3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med16Q6PGF3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms