Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtifQ6PEE2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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