Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

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Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dtx4Q6PDK8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dtx4Q6PDK8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dtx4Q6PDK8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dtx4Q6PDK8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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