Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gapvd1Q6PAR5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gapvd1Q6PAR5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms