Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
BC061212Q6P8K3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms