Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6P7

Parp6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp6Q6P6P7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp6Q6P6P7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Parp6Q6P6P7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms