Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc148Q6P5U8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc148Q6P5U8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms