Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg2aQ6P4T0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms