Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y5

Znf280c, Zinc finger protein 280C, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280cQ6P3Y5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf280cQ6P3Y5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms