Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slx4Q6P1D7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms