Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Asic1Q6NXK8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Asic1Q6NXK8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms