Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf6Q6NVF9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms