Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdcd11Q6NS46 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdcd11Q6NS46 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms