Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CltbQ6IRU5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms