Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hecw2Q6I6G8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hecw2Q6I6G8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms