Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil1Q6EDY6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil1Q6EDY6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms