Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smarca2Q6DIC0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smarca2Q6DIC0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms