Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo27Q6DIA9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Fbxo27Q6DIA9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fbxo27Q6DIA9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fbxo27Q6DIA9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms