Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp11bQ6DFW5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp11bQ6DFW5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms