Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cep290Q6A078 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cep290Q6A078 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cep290Q6A078 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cep290Q6A078 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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