Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Pdzrn3Q69ZS0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdzrn3Q69ZS0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdzrn3Q69ZS0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pdzrn3Q69ZS0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdzrn3Q69ZS0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pdzrn3Q69ZS0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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