Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usf2Q64705 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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