Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Krt12Q64291 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms