Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifit1Q64282 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ifit1Q64282 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms